2008年――謎の勢力の出現により、                                   　　アニメ、ゲーム、マンガ、音楽、鉄道、コスプレなどあらゆるオタク文化が排除された日本。                                   　　グッズは収容され、保護の名のもとにオタクが弾圧されても、                                   　　人々は自我を喪ったかのように疑問を持たない。                                   　　秩序維持を担う組織「SSC」に蹂躙され、オタクは滅びたかに思われた――                                   　　だが、封鎖されたアキバを奪還し、反旗を翻す者たちが現れる。                                   　　若き革命者「オタクヒーロー」――何よりもオタク文化を愛し、誰よりもアキバを愛する男。                                   　　そして彼を慕う3人の魔法少女たち――「アナーキー」「ブルー」「ピンク」。                                   　　2011年の日本を舞台に、自由の旗のもとに集ったオタクたち――                                   　　アキバ革命軍は、SSC首領「SHOBON」との壮絶な戦いに挑む。                                   　　混沌も秩序も破壊して、好きなものを好きなだけ好きといえる世界のために。                                   　　自由の旗のもとに集ったオタクたちよ、                                   　　奪われた文化を取り戻すべく                                   　　OTAKUCOUNTERCULTUREを巻き起こせ！